Synthese von Vancomycinsonden für Activity-Based Protein Profiling

Bachelorarbeit , 2008 , 49 Seiten , Note: 1.7

Chemie - Organische Chemie

In den letzten Jahren kamen Hinweise auf, dass Chlorbiphenyl-Derivate von Vancomycin direkt Proteine blockieren, die an der Peptidoglycan-Synthese beteiligt sind. Einige solcher Proteine, die PBPs konnten schon in der Membranfraktion von E. coli identifiziert werden. Ziel dieser Arbeit ist es, weitere zelluläre Angriffsziele von Chlorbiphenyl-Derivaten von Vancomycin zu finden. Hierzu wurde die Methode des Activity Based Protein Profiling (ABPP) angewandt. Es wurden mehrere Sonden mit unterschiedlichem Aufbau synthetisiert und an den Proteomen der Gram-positiven Bakterien B. subtilis, Listeria welshimeri und Bacillus licheniformis sowie der Gram-negativen Bakterien Pseudomonas putida und Escherichia coli getestet.

INHALTSVERZEICHNIS

1 INHALTSVERZEICHNIS

2 ABKÜRZUNGSVERZEICHNIS

3 ALLGEMEINER TEIL
3.1 VANCOMYCIN
3.1.1 Entdeckung und klinische Verwendung
3.1.2 Struktur
3.1.3 Wirkmechanismus
3.1.4 Resistenzmechanismus
3.2 RESISTENZ-ÜBERWINDENDE VANCOMYCIN-DERIVATE
3.3 THEORIEN ÜBER RESISTENZÜBERWINDUNG

4 AUFGABENSTELLUNG

5 SYNTHESEPLANUNG UND SONDENDESIGN

6 ERGEBNISTEIL
6.1 SYNTHESE
6.1.1 Synthese von Sonde 1
6.1.2 Synthese von Sonde 2
6.1.3 Synthese von Sonde 3
6.1.4 Versuch der Synthese von Sonde 4
6.2 IN VITRO MARKIERUNGSEXPERIMENTE
6.2.1 Allgemeines
6.2.2 In vitro Markierung im Proteom von B. subtilis
6.2.3 In vitro Markierung im Proteom von L. welshimeri
6.2.4 In vitro Markierung im Proteom von B. licheniformis
6.2.5 In vitro Markierung im Proteom von P. putida
6.2.6 In vitro Markierung im Proteom von E. coli

7 ZUSAMMENFASSUNG DER ARBEIT

8 AUSBLICK

9 EXPERIMENTELLER TEIL
9.1 SYNTHESE
9.1.1 Allgemeines
9.1.2 Synthese von N V -p-Bpoyl-vancomycinamid (5)
9.1.3 Synthese von N V -p-Bpoyl-C-propagylamid-vancomycinamid (Sonde 1)
9.1.4 Synthese von N V -Hexinoyl-vancomycinamid (6)
9.1.5 Synthese von Fmoc-Glycyl-4-benzophenonamid (8)
9.1.6 Synthese von N-(3-Aminopropyl)-4-benzoyl-benzamid (9)
9.1.7 Synthese von N V -Hexinoyl-C-(p-Bpoyl-1,3-diaminopropanamid)-vancomycinamid (Sonde 2)
9.1.8 Synthese von N V -(N-Hexinoyl-Phe(4-benzoyl)oyl)-vancomycinamid (Sonde 3)
9.1.9 Synthese von H 2 N-Phe(4-benzoyl)-propagylamid (12)
9.1.10 Versuch der Synthese von N V -Hexinoyl-C-p-Bp-amid-vancomycinamid (7)
9.1.11 Versuch der Synthese von C-(Phe(4-benzoyl)-propagylamid)amid-vancomycin (Sonde 4)
9.2 I N VITRO MARKIERUNGSEXPERIMENTE
9.2.1 Verwendete Materialien
9.2.2 Durchführung des Markierungsexperiments

10 LITERATURVERZEICHNIS

• Hochschule: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Note: 1.7
• Autor: Igor Pochorovski (Autor:in)
• Erscheinungsjahr: 2008
• Seiten: 49
• Katalognummer: V175513
• ISBN (eBook): 9783640965120
• ISBN (Buch): 9783640965250
• Sprache: Deutsch
• Schlagworte: sythese, vancomycinsonden, activity-based, protein, profiling